42年~53年: 漁撈科-漁業資源之開發與利用-大量資源時期
53年~82年: 漁業學系-海洋生物生產系統-有效利用資源時期
82年~91年: 漁業科學學系-漁業資源管理-合理使用資源時期
91年~迄 今: 資源管理與環境生態-知識經濟與資源循環時期
透過研究的教學,達到知識經濟與資源循環之永續漁業資源管理與環境生態保護的教育目標
基於「以海洋漁業為主,但不以海洋漁業為限」的思維,以培育環境生物、漁業技術、漁場生態、海洋環境保護、漁業資源保育與復育、環境生物評估與管理等領域之人材為宗旨;在大學部著重於環境生物與漁業科學之基礎養成專業知識教育、教導漁業資源、海洋生物生產及漁業資源管理等,碩士班、博士班則是透過研究教育,以培育研究及管理階層之人材,同時搭配碩士在職專班回流教育,深植海洋環境及漁業資源保育之教育基礎,以達到知識經濟與資源循環之永續漁業資源管理與環境生態保護的教育目標。
漁業產業的經營,主要仰賴海洋生物之自然資源,而海洋生物為一種可再生資源,在有效管理及合理利用制度下,海洋生物資源即可生生不息,永續利用 。 過去海洋商業捕魚主要以生產為導向,導致全球漁業資源有過度捕撈的狀況,因此如何保護與管理海洋漁業資源,已引起世界各國的高度關注與重視,當然也受到國際漁業管理組織及環保團體的積極介入。 本系為研究海洋漁業及環境生物之最高學府, 應善用我國之生態環境優勢及漁業經營實力,以漁業活動,配合研究,蓄積海洋環境與生態系之知識,對生物資源之保育與合理開發提出因應對策,善盡漁業強國的責任,同時 培育新世代之漁業研究、企劃、管理人才,並 以「生態環境保護」、「資源保育」及「永續利用」為前提,推動符合生態漁業之管理模式,建立資源管理型漁業。